淮军既然已经成军，陈济怀便安排通过水路将其运至了苏南。
其实，陈济怀岂能不知曾国藩对苏南的图谋。他引淮军来，除了迫于战局需要，也是有算计在其中的，并且和几位兄长都做过商议。
淮军初到苏南时，将士衣装简旧，手中武器也仅为大刀、长矛和弓矢之类。为了训练这支万人规模的新军，陈济怀与李鸿章商议，决定先将其置于太仓州内，专作整训。
根据之前议定的，淮军在来援期间，全部的给养和粮饷，以及武器装备，皆由苏南供应。而其服制、旗帜和营制，则由李鸿章搬照湘军的制式，略作改进而成。因此有别于商团建制。
陈济怀为淮军准备的武器装备，全部为西洋火器。这些武装，主要是一些商团过去曾经装备过，但现已换装不用了的前装枪械。
其实在当前的技术条件下，设计优秀的前装枪并非落后的装备。由于后装枪存在漏气的问题，解决的办法也还未得到全面普及。技术成熟的前装枪，在使用中则更加安全可靠，也得到很多西方军队的青睐。
因此，前装枪也是非常适用于编练新军的。提供给淮军的枪械，就是一些不错的前装枪。
这些枪械主要有，美制的，密西西比式m1841型前装来复枪。点54口径，枪身全长48.5英寸，枪重9.25磅，有效射程1,100码。
还有少量的，英式恩菲尔德p1853型前装来复枪。点577口径，枪身全长55英寸，枪重8.7磅，有效射程900码。
此外，陈济怀还向他们，提供了12门拿破仑式m1841型6磅野战炮。
为了帮助淮军尽快掌握这些武器，陈济怀特意从商团军中临时抽调了，一些富有经验的下级官长和勇员。专门负责为淮军讲授武器操作和射击。
至于行军、队列、号令和战法等，由于淮军和商团，在营制和体系等方面都不相同，就只能由李鸿章自己想办法了。
尽管如此，这些火器，仍比太平军、清军，甚至湘军在用的武器先进很多。而且全部以火器为武装的建军形式，令李鸿章等人耳目一新，大开眼界。
陈济怀与李鸿章约定，至少在一、二个月内，将不赋予淮军作战任务。要他们抓紧时间操训，尽快形成战力。
可太平军却不会等待，浙江的局势也在一天天的恶化。
就在京城那边的当朝权贵们，正忙着政变夺取的那段日子，浙江北部地区，除杭州和宁波外，余下州府皆已落入太平军之手。而宁波府在一个月后，也被攻占。
在这期间，陈济怀安排了大量的人力、运船，抢运象山老家的乡里。将他们运至苏南安置。
为了防止浙北的太平军北上，陈济怀还将越来越多的商团南军调往南线。原本形势已渐好转的苏州至常熟一线，兵力又捉襟见肘起来。
北线的太平军，正是看到了商团的这些情况，便也不安分了起来。他们从围困常熟的军中，分出三万余兵力，长驱直入，再次向昆山袭来。
此时，商团留在昆山一带守备的，仅有第三十四营等千人左右。侦得太平军来袭后，陈济怀见手中兵力实在过于分散，只得邀李鸿章的淮军就近西进助战。同时又从南线抽出第八团的第十八营，自松江北援。