对于陈济怀的说辞，琉球王尚泰与其臣属们，自是无有不从。
如今除了仰仗陈济怀之外，面对着国家一系列的问题，他们也找不出旁的方法来解决。
于是在接下来的几日里，琉球王便在陈济怀的指导下，对琉球国的内政外交开始了整顿。
在内政上，裁汰替换掉亲日派官僚后，琉球国原本被日本人或亲日派把持的各项政务，终于重归自主。
但如今琉球国已与列国缔约通商，也由此产生了许多，如海关事务等，新的政务。对于这些，琉球人并无经验，只能由陈济怀派人协助开展。
在防务上，琉球国原本的军队，兵力不足，装备落后，战力孱弱。
在日本人长期的限制下，更是除了执行典仪、护卫、巡捕之类的任务外，几乎无实战能力，形同虚设。
因此，尽管首里城和那霸的日军已被陆续剿灭干净，但清理琉球其他地方，收复被占的奄美诸岛，以及今后琉球的防务，就只得依靠商团的力量。
在外交方面，琉球国完全没有开展近代外交事务的经验，所以由陈济怀帮助其建立机构，逐步学习办理，也成为琉球唯一的选择。
至于陈济怀所说的三件要务，自然也需由其指导完成。
其中，发给列国的照会，和代行征伐的授权，相对好办一些。无非是明确主旨和行文模式后，由琉球的文臣自行撰写，审验合格也便成了。
最重要的《琉球驻防协定》，则基本上出自陈济怀之手了。
在最后定稿签订后，这个协定瞧上去，却更像是一份琉球国的单方声明。因为签署的双方，一方为琉球国，另一方却只有陈济怀的画押。
直到后来，在陈济方加盖了两江总督关防后，才算是让这份协定看起来更像那么回事儿些。
不过这些并不影响协定的效力，因为在其文中有述，此协定内容在签署后，即行生效，无问署者为何。
这也开创了，陈家兄弟在无大清朝廷的授权下，私自缔约的先例。
《琉球驻防协定》的要旨有五项。
其一，明确了琉球国永为中原天朝的属臣，并接受中原为其提供的庇护，其内外一切政务也要接受中原的指导。
其二，为保卫国土臣民，琉球国诚请护商民团来国驻防，并授予其，代为征伐的权限。
其三，商团来琉球驻防，所需兵额多少，是否增减，何时增减，皆自行决断，并由琉球国提物资供给养和兵饷。
其四，商团来琉球驻防，所需占用土地和设施，在知会当地官府后，由当地妥为安排。驻防地域内一切事务，由驻防商团自行管理。
其五，商团帮助琉球国编练新军。
再过了几日后，陈济怀统领的远征舰队，已经彻底控制了琉球本岛。
他一面帮着琉球君臣稳定局面。一面又四处派出军力，收控周边的其他岛屿。
同时他还派遣了“九华山”号巡航舰返回上海，向国内传递琉球这边的消息。
并且要求后方，向琉球加派人员和物资，协助琉球开展建设，也准备下一步进军奄美。
陈济方得知远征琉球大获成功，十分高兴。对于四弟的要求，他也是全力支持。