深海猎人的强大有目共睹，换成是普通的阿戈尔人让他们以猎人们的作战条件上战场，恐怕连怎么死的都不知道，在不使用武器的情况下，深海猎人无疑就是一支无敌的军队，连海怪都对他们束手无策。
但一个非常严重的问题始终困扰着深海猎人——海嗣化。
深海猎人获得海嗣血脉的同时也注定会深受其影响，就像一万年前的阿戈尔人担忧的那样，深海之力的使用将会大幅度加速阿戈尔人海嗣化的进程，如果预想没有错误的话，这些深海猎人的结局除了战死就只剩下了变成海嗣这一条途径。
也就是说，深海猎人是一个定时炸弹，执政院无法把控这个炸弹什么时候会炸掉。
一开始，深海猎人海嗣化的问题还没有那么明显，但随着时间的推移和战斗次数的增加，越来越多的深海猎人有了海嗣化的迹象，并且军团里已经有出现猎人变成海嗣屠杀同胞的事发生，歌蕾蒂娅尽力封锁消息，避免透露风声影响士气，但瞒得过猎人却瞒不过执政院。
作为对抗海嗣和深海之神而人工创造出来的产物，现在反而被发现最终会变成新的海嗣而成为阿戈尔的敌人，一时间，执政院内七嘴八舌，他们在激烈争论着该如何应对这支队伍。
在当时，执政院内部对深海猎人的观点非常矛盾，不管是建构派还是原初派，接纳亦或是处置深海猎人的声音都存在，但在当时，两派里各自人数最多的中间派一致认为，为了阿戈尔未来的稳定，应该处置深海猎人。
建构派认为，深海猎人虽然是个很好用的武器，但存在反噬的风险，在建构派的坚持下，执政院又设立巡海者守卫实时监控深海猎人，一旦深海猎人出现变异迹象，可以直接将其抹杀。
讽刺的是，巡海者守卫也是接受了海嗣血脉改造的阿戈尔人，但由于不用像深海猎人那样经常奔赴战场，因此他们的海嗣化进程远远慢于深海猎人。
至于深海猎人被抹杀后阿戈尔又该怎么办，建构派的建议是继续进行人体实验制造新的一批深海猎人，当他们也走向海嗣化后又将其抹杀掉，再周而复始，深海猎人被当做了周期性替换的工具。
而原初派的想法则简单得多，由于深海猎人几乎全都是盖密尔人出身，从意识形态上来讲就属于原初派的政敌，建构派凭借着深海猎人的功绩在执政院里巩固了领导地位，原初派无法接受深海猎人这个组织。
对应的是，在当时，深海猎人也很看不起执政院内只会制造内部矛盾却对这场战争难有作为的原初派，原初派对战争的态度非常消极，他们认为这场灾难总会过去，就像之前的两次一样，阿戈尔需要做的只是防御就好了，根本没有必要发起反击，双方常常在战术规划上有诸多矛盾。
更令深海猎人感到无法理解的是，原初派认为神无法死去，但又认为在这场战争中万万不可以击杀神，因为他们认为如若神死去很可能会动摇深海之力的根基，影响阿戈尔的发展，即便现在的事实已经证明了神的苏醒早就改变了深海之力的属性。
总之，在当时，无论是哪一个派别，他们对深海猎人都很不满意，后方悠哉游哉的执政官们却在疯狂拉前方奋勇杀敌战士们的后腿。
深海猎人也感受到了来自执政院的恶意，虽然作为执政官的歌蕾蒂娅在尽力安抚双方的矛盾，但终究无法释怀，到后来，连歌蕾蒂娅和执政院都已经失去了彼此之间的耐心。
最终，经历了多年的征战，深海猎人军团已经饱受摧残，绝大多数猎人们要么战死，要么变成海嗣而被巡海者守卫处死，原本一个军团的兵力现在已经剩下不到一个支队，而剩下的这些人也大都到了海嗣化的中后期，非常危险。
执政院认为，深海猎人劳苦功高，他们为阿戈尔奉献了他们的一生，是阿戈尔的骄傲，并且一致决定，将剩下的深海猎人全部送上死路，这是作为他们功绩的回报。
在一次探测行动中，执政院检测到了神的踪迹，并将所有的深海猎人全部派往神的居所，这场刺杀深海之神的行动，也是执政院为了一次性处理掉全部深海猎人，而设计的自杀计划。
深海之神不可战胜，这是当时阿戈尔两派的主流共同观点，这个计划完全是为了人为销毁掉深海猎人这个失败的产物，并防止他们落入敌手而设计的。
包括歌蕾蒂娅在内的一些深海猎人也深知执政院的用意，但他们还是义无反顾地选择了保护他们的人民，冲向他们的敌人，虽然他们所保护的人，正是将他们送上死路的刽子手。
在此之后的一段时间里，执政院为了防止这个技术的真相暴露，将此技术的信息视作禁忌给彻底封锁，连同深海猎人的消息也被封锁，在执政院的舆论操控下，曾经在大名鼎鼎的深海猎人军团，也逐渐销声匿迹。
但执政院没有想到的是，深海猎人并没有全部丧生，强大的体质让他们即便经历了那么惨烈的战斗后依旧活了下来，而且还不止一人。
并且令人更加惊讶的是，虽然现在依旧不清楚原因，但他们竟然做到了让深海之神再度陷入沉睡，战争竟然就这么突然结束了。